Chuyến Tàu Băng Giá (Phần 3) kể về sáu tháng sau, Layton tiếp tục tìm kiếm nơi đủ điều kiện duy trì sự sống trên Trái Đất, còn Wilford vẫn sốt sắng truy lùng trong nỗi căm phẫn và khao khát trả thù.